Hafner và ctv. (2007)[2] tóm tắt các dữ liệu phân tích hình thái và phân tử đã có để đề xuất sơ đồ phân loại như sau:

• Họ Heteromyidae
  • Phân họ Heteromyinae (Chuột gai bìu má)
    • Chi Heteromys: Chuột gai bìu má rừng
    • Chi Liomys): Chuột gai bìu má
  • Phân họ Dipodomyinae (Chuột nhảy hai chân)
    • Chi Dipodomys: Chuột nhảy hai chân
    • Chi Microdipodops: Chuột nhảy hai chân nhỏ
  • Phân họ Perognathinae: Chuột bìu má
    • Chi Perognathus: Chuột bìu má lông mượt
    • Chi Chaetodipus: Chuột bìu má lông ráp

Phần lớn các tác giả khác trước đó như Alexander & Riddle (2005)[3]; Patton (2005)[4] coi Liomys như là chi khác biệt với Heteromys.